护者、英勇无畏的瞿式耜也皈依了天主教，取教名托马斯，这位基督徒军人，为南明王朝的末日增添了光彩。1650年，耶稣会神父卜弥格[2]离开桂林，代表南明王朝去欧洲请求基督教国家的帮助。但就在同一年，一支清军带着不惜一切代价征服两广的使命被派往南方。在他们逼近的时候，软弱无能的朱由榔惊恐不已，不顾瞿式耜的恳求，逃出了桂林。尽管被主子抛弃，手下的将士也逃掉了一半，但瞿式耜依然领着最后留下来的追随者保卫着桂林。城市最终还是被攻克了，战斗到最后的瞿式耜被俘。满族人遵循他们一贯的策略，试图获得他的支持，在毅然拒绝背叛主人之后，瞿式耜被斩首。由于他的英雄主义精神，征服者为他举行了隆重的葬礼（1650年）。不久之后，满族人攻克广州，朱由榔逃往缅甸（1651年）。

明朝大业最后的捍卫者是郑成功，荷兰人与葡萄牙人都叫他koxga（国姓爷，这是中国老百姓对他的称呼）。

郑成功是远东历史上最奇特的人物之一，是海上中国首屈一指的、也是与生俱来的代表，其在太平洋与印度洋各沿岸地区的扩张，是19世纪最重要的事件之一。郑成功的父亲郑芝龙是个普通渔民，后来成了一名海盗首领。郑芝龙的年轻时代是在澳门度过的，葡萄牙人在那里给他施洗；随后他生活在西属马尼拉，又从那里去了日本，在日本娶妻成家，郑成功就是这次婚姻的产物。回到中国后，郑芝龙成了一名为明王朝效力的海盗，在浙江、福建和广东沿海抗击满族人（1645年），后来被人出卖，成了满族人的阶下之囚，被押送到北京，从此再也没有回来（1646）。他的儿子郑成功发誓要为父亲报仇。郑成功扬帆出海，率领他神出鬼没的小舰队，16年来不屈不挠地对南部沿海各省的总督展开了海上游击战。

郑成功是从获取岸上的可靠根据地开始的。1653年，他建立了一支以福建的厦门岛为基地的海军。1656年，他攻占了崇明岛，那里控制着长江的入海口。1659年，他溯江而上，大胆地围攻南京城。被击退之后，他把注意力转向了台湾岛，自1625年以来，荷兰人就在那里扎下了脚跟。他在自己的厦门老巢集结了一支强大的舰队，于1661年4月30日在台湾岛登陆。1662年2月1日，在